Eu nu as renunta la wordpress ca platforma. E destul de buna fata de alte CMS-uri, mai ales dpdv SEO. Problema e cu plugin-urile third party. Renunta la ce nu e absolut necesar.
Sau si mai bine, daca tot ai optiunea sa faci devel, decat sa iti faci propriul cms, mai bine optimizeaza plugin-urile. Daca se poate.
Ca sa refaci site-ul de la 0, chiar daca folosesti un frameword gata scris, gen codeigniter, o sa iti ia ceva timp si bani. Dar la final un cms custom o sa iti aduca rezultate mai bune in Google daca e bine facut.
Eu am avut o astfel de experienta si am trecut la cms custom de pe Joomla. A fost un miracol. Wordpress totusi nu e Joomla, se comporta mai bine.

--- Later Edit --- (ca mi-a fost lene sa apas "Edit")

Ar fi bine sa faci o solutie in care toate vechile url-uri sa serveasca redirect 301 catre noile url-uri. Iar ulterior dupa ce noile adrese au fost indexate le poti exclude din Google Webmaster Tools. Daca va fi nevoie si nu le va servi Google automat pe cele noi.