Nu are niciun efect adica gwmt iti arata erori in continuare? E normal, caci nu se updateaza imediat (google face request pentru acele URL-uri pana se plictiseste - daca nu mai exista niciun link catre ele, eventual vor disparea). Din experienta mea, pentru un numar mare de erori, va dura o vreme, trebuie sa ai rabdare. Cat despre eventuale penalizari aduse pentru faptul ca ai atatea erori, nu-ti face griji.

PS: functia remove URL ti le scoate doar din index, nu si din tool