Problema e ca paginile vechi trebuie scoase din index si URL-urile noi sa le ia locul. Daca le schimbi direct, paginile vechi vor fi scoase din Google, iar cele noi vor fi tratate ca noi. Doar prin redirectari ii poti spune lui Google ca cele noi sunt in relatie cu cele vechi (astfel primesc beneficiile celor vechi).

Daca faci treaba cu subdirectorul, paginile vechi si inutile vor ramane in index. In plus, articolul de pe pagina veche (presupun ca acest continut va ramane si in versiunea noua a sitului) va aparea si pe pagina noua. => Continut dublu, deci Google ar putea decide sa nu returneze noua pagina in SERPs.

Eu raman la parerea din primul meu post. Iar daca e greu, vezi care pagini sunt mai importante si pune redirecturi doar pt ele.