Din punct de vedere seo, ambele variante sunt la fel de bune. Din punct de vedere al usurintei in utilizare - deci pentru utilizator - varianta cu folder este mult mai indicata, urmand un pattern logic/normal.

site.com/dezmembrari-auto/timisoara/bmv

este mult mai logic, normal, mai usor de tinut minte, etc, sau cum vrei tu sa-i spui decat

timisoara.site.com/dezmembrari/bmw

Google va trata ambele URL-uri in acelasi fel... Important este cum este perceput de utilizatori si cate clickuri are nevoie un utilizator sa ajunga in punctul dorit.

Faceti siteuri pentru oameni... Motoarele de cautare imita din ce in ce mai bine modul de perceptie si de folosire al siteurilor de catre oameni.

Ar fi haos ca peste 1 an, doi, cand ajunge siteul tau la 20,30, 50 de mii de pagini indexate, sau poate chiar mai multe, sa te apuci sa schmbi structura url-urilor, etc ...