Probabil PR-ul si-l lua din linkuri puternice catre ceva pagini interne, care lasau link juice-ul sa treaca catre root. In momentul in care a schimbat structura (fara redirect), paginile au inceput sa returneze 404, iar link juice-ul s-a evaporat.

Mi se pare ciudat ca avea PR3 din moment ce pare sa aiba doar doua linkuri catre el, posibil sa fie un bug / recalculare de PR.