Brainstorming robots + Url not found + unreachable URL`s

Povestea este lunga. Am avut un virus pe care nu l-am depistat nici pana acum ( nici eu, nici hostingul, nici prietenii ). Virusul era foarte destept:
1. Crea pagini de genul asta http://site.ro/index.php?medicamente/ - verificati pe majoritatea paginilor cu wordpress - un astfel de link redirectioneaza catre http://site.ro/?medicamente/ sau http://site.ro
2. Introducea vreo 1000 de link-uri in header, iar dupa ce era luat in cache-ul google dispareau link-urile. Link-urile nu le-am vazut niciodata live cu medicamente gen viagra ci doar in google cache.
3. Cred ca facea 100 de pagini pentru fiecare pagina noua generata. Iar un post cu 4-5 tag-uri genera vreo 100 de astfel de pagini in google index, restul probabil nu erau indexate.

Ce am facut:
1. am schimbat hostingul.
2. am sters blogul in intregime, cu WP si BD si mi-a facut niste txt-uri doar cu posturile si cu tag-urile, pe care le-am pus din nou, pe o noua tema, un nou wordpress, un nou director site1.
3. In robots.txt am restrictionat paginile care contin index, semnul intrebarii ( intr-un fel toate paginile spammy ).

Momentan nu toate aceste pagini au URL not found, doar o parte din simplul motiv ca tag-urile si unele titluri ale posturilor au ramas la fel.

Am luat in considerare scoaterea din google index insa nu este o solutie, deoarece abia dupa 90 de zile site-ul poate fi reintrodus. Momenat sunt 13000 de pagini indexate si ar trebui sa fie maxim 1000.
Dupa ce am pus robots-ul 3600 sunt not allowed to crawl by robots.txt, alte 4-5 mii cred ca au url not found, google a gasit doar vreo 100.

Ce-i de facut?
1. Sa cer reconsiderare ? Oare vor disparea aceste pagini? Eu n-am probleme cu site-ul chiar daca problema asta persista de 7 luni. Ma gandesc ca o reconsiderare mi-ar aduce numai dezavantaje in SERPS.

2. Paginile interzise de robotx.txt vor disparea din google index? Momentan trendul este de crestere al paginilor indexate de la 11000 ( cand am sters blogul si l-am pus din nou ) la 14000 - insa nu am sesizat noi pagini cu medicamente ( viagra ).

3. Cum am spus site-ul sta exact cum cred ca ar trebui in SERPS si link-urile sunt valoroase pentru care au link-uri pe site-ul asta. Deci nu exista nici un fel de penalizare, exista doar problema asta sesizabila cu site:site in index-ul Google.

Eu as vrea ca numarul lor cel putin sa scada insa nu am nici o solutie nici de la un expert PHP, nici de la hosting nici de la priceputi Wordpress. Are cineva vreo idee?